Автоматизация окрашивания на каждом столе для более качественной и воспроизводимой визуализации тканей

Parhelia Omni-Stainer™ автоматизирует протоколы пространственной биологии, сокращая при этом затраты на реагенты.

Спонсорский контент, предоставленный вам

Микроокружение опухоли представляет собой сложную совокупность раковых клеток, иммунных клеток, стромальных клеток и компонентов внеклеточного матрикса. Взаимодействие между этими компонентами может существенно повлиять на рост опухоли и реакцию на лечение. Определенный прорыв в нашей способности картировать микроокружение опухоли произошел с наступлением эры пространственной биологии, когда различные методы мультиплексной визуализации теперь используются для картирования десятков типов клеток in situ, а сложные вычислительные алгоритмы используются для количественного моделирования их взаимоотношений в опухоли. контекст. Эти многоэтапные протоколы очень дороги, имеют серьезные ограничения по пропускной способности образцов, склонны к вариациям результатов анализа и их трудно адаптировать и стандартизировать в нескольких лабораториях.

Видение Пархелии состоит в том, чтобы положить начало новой эре воспроизводимой биологии, в которой соответствие, воспроизводимость и надежность исследований достигаются за счет внедрения подотчетной автоматизации на уровне отдельного кабинета. В рамках этой концепции протоколы будут передаваться между лабораториями не посредством индивидуального обучения и кропотливого обратного проектирования методом проб и ошибок, а скорее посредством совместного использования загружаемых сценариев автоматизации с открытым исходным кодом, которые можно будет развернуть одним нажатием кнопки. Заставляя исследователей переводить зачастую неявные знания о мельчайших деталях сложных протоколов в точные и явные роботизированные команды, это позволит быстро распространять, легко внедрять, создавать версии и независимую проверку новых протоколов сообществом коллег.

Чтобы обеспечить такое будущее и решить растущие проблемы в исследованиях в области пространственной биологии, компания Parhelia Biosciences создала Omni-Stainer™, революционную рабочую станцию ​​для окрашивания тканей, способную беспрепятственно выполнять множество пространственных анализов. В отличие от громоздких гистологических автостейнеров прошлого, Parhelia Omni-Stainer™ представляет собой компактное настольное устройство, цена которого намеренно соответствует бюджету капитальных затрат исследовательских лабораторий среднего размера (<15 тысяч долларов США).

Parhelia Omni-Stainer — это модульный прибор, построенный на шасси устройства обработки жидкостей формата SBS с открытым исходным кодом. Модули предназначены для использования в различных форматах окрашивания тканей, включая обычные образцы, закрепленные на предметном стекле, а также более экзотические образцы, закрепленные на покровном стекле, которые все чаще используются в пространственных анализах, таких как CODEX или smRNA-FISH.

В каждом модуле параллельно размещается до 12 образцов, а в Omni-Stainer можно установить до 10 таких модулей, что обеспечивает максимальную пропускную способность 120 образцов за один цикл. Модули Omni-Stainer могут быть оснащены блоками Пельтье с программным управлением, позволяющими точно контролировать температуру в диапазоне 0–99°C. Это позволяет использовать анализы с контролируемой температурой на Parhelia Omni-Stainer, включая протоколы ISH, лигирование и амплификацию ДНК, циклические анализы IF и TSA, такие как Opal.

Эффективное и равномерное окрашивание образцов достигается за счет замены капиллярных зазоров, что является ключевой особенностью Omni-Stainer. Образцы инкубируются в тонком капиллярном слое жидкости толщиной 60 мкм, что значительно снижает использование дорогих реагентов, таких как конъюгаты ДНК-антитела или зонды FISH.

Непревзойденная гибкость Parhelia Omni-Stainer позволяет создавать произвольные сложные протоколы с помощью простого API Python. Кроме того, Parhelia предоставляет своим пользователям доступ к StainWorks, мощному веб-приложению, которое содержит общий репозиторий проверенных протоколов и позволяет пользователям изменять и запускать эти протоколы, не касаясь какого-либо кода. В настоящее время StainWorks содержит проверенные протоколы для IF, IHC, CODEX (PhenoCycler), IMC, Opal и RNAScope, и этот список постоянно расширяется.

Parhelia Omni-Stainer уже используется в ведущих исследовательских институтах, включая Стэнфорд, Гарвард, Броуд, MD Anderson, Mayo Clinic, WUSTL, а также в научно-исследовательских фармацевтических учреждениях, включая Novartis и Genentech.